Shinichi Kudo est un jeune homme de 17 ans, détective de génie à ses heures. Au cours d'une enquête, il est fait prisonnier. Mais plutôt que de le tuer, les bandits, des hommes en noir lui font absorber une substance qui le transforme en garçon de 6 ans. Ses parents vivant à l'étranger, il est recueilli par Ran son amie d'enfance et son père, un détective sur la touche, sous le nom de Conan Edogawa, neveu du professeur Agasa, ami des parents de Shinichi. Le jeune homme à l'aspect d'enfant, n'aura de cesse de retrouver sa véritable apparence...
La dernière enquête voit l’entrée en scène une femme qui prétend être la mère de Conan...
Enigmes principales:
L'homme aux bandages. Meurtre au Karaoke. Des visiteurs inconnus.
Un matin, une femme se faisant passer pour la mère de «Conan Edogawa» et un mystérieux homme masqué font leur apparition. Membres présumés de l’organisation des hommes en noir, ils ont en leur possession, le poison que Conan recherche et s’apprêtent à perpétrer un nouveau crime... Conan se lance à leur poursuite pour tenter de les en empêcher mais...