Le métier de "Magical girl" consiste à débarrasser le monde des "monstres", classés parmi les phénomènes naturels. Fraîchement diplômée, Kana Sakuragi peine à trouver un emploi quand elle fait la rencontre de l'employée d'une start-up de magical girl au cours d'un entretien d'embauche. Pour Kana, c'est la porte d'entrée vers le monde du travail et le début des aventures comme magical girl !
Kana est envoyée en mission en binôme avec Makino, en formation chez Magilumière. Elles se retrouvent en mauvaise posture, mais Koshigaya se précipite pour voler à leur secours… Par ailleurs, le « système Alice » de Magilumière est mis à l’ordre du jour lors d’une réunion à laquelle participent différents acteurs du secteur de la magie.
Afin de faire reconnaître l’importance de son système et de le diffuser largement pour le bien des magical girls, Shigemoto envoie ses employées éliminer un monstre d’un genre nouveau, dont l’existence avait été jusque-là gardée secrète !